Un établissement culturel aussi important et complexe qu'un musée doit s'entourer de partenaires afin d'accomplir convenablement l'ensemble des missions qui lui incombent.

Depuis 1988, la Caisse d'Epargne et la ville de Saint-Flour se sont associées pour donner au musée d'art et d'histoire Alfred-Douët les moyens de sa politique ambitieuse.

D'autres partenaires viennent également soutenir régulièrement des actions ou des projets ponctuels de l'établissement, comme le Ministère de la Culture et de la Communication (Direction des Musées de France, DRAC Auvergne), le Conseil Régional d'Auvergne ou encore le Conseil Général du Cantal.

Fervent partisan du travail en réseau, le musée adhère et participe activement à l'Association pour la Promotion des Musées d'Auvergne (APROMA).